En el Laboratorio de Mineralogía se realiza caracterización mineralógica, cualitativa y cuantitativa, herramienta fundamental aplicada en el campo de la minería, para la exploración, explotación, procesamiento de mineral y comercialización.
Este laboratorio está constituido por tres áreas fundamentales: Microscopía óptica, Difracción de Rayos X, Microscopía Electrónica (SEM) y Espectrometría (EDS). Los estudios que realiza y brinda el laboratorio son utilizados tanto para proyectos de investigación, como para desarrollo de tesis de estudiantes de grado y posgrado. Además, esta unidad de investigación ofrece servicios a empresas de la industria minera.
En el 2023 obtuvo la certificación ISO 9001:2015, IRAM – IQNET hasta el 2026.